天昊生物全外显子测序技术(wes)平台又有重磅文章面世!
福建医科大学附属第一医院神经内科陈万金教授、王柠教授团队与中国科学院神经科学研究所熊志奇研究员团队,近日发现原发性家族性脑钙化症(primary familial brain calcification,pfbc)首个隐性致病基因myorg。6月14日,神经科学领域杂志《neuron》以“biallelic mutations in myorg cause autosomal recessive primary familial brain calcification”为题在线发表了这一成果。天昊生物有幸参与了部分家系样本的外显子测序工作。在恭喜天昊生物客户发表重磅文章的同时,我们想第一时间和大家分享一下这篇文章的研究思路。
英文题目:biallelic mutations in myorg cause autosomal recessive primary familial brain calcification
中文题目:myorg双等位基因突变引发常染色体隐性原发性家族性脑钙化症
期刊名:《neuron》
发表时间: 2018年6月
影响因子:14.024
研究背景
研究方法
研究结果
收集51个pfbc家系,首先进行目的区域测序,确定携带4个已知基因(slc20a2, pdgfb, pdgfrb, xpr1)变异的家系数目。共有27(52.9%)个家系检测到已知致病基因变异。
首先选择了一个近亲婚配家系,对2个同胞患者(v7和v9)和一个同胞非患者(v5)进行wes,寻找纯合突变(下图家系1)。wes结果确定了5个可能的致病基因:ddx1, rabgap1l, myorg, zcchc6,tmem2。
对家系2的2个同胞患者(iii4和iii6)和一个同胞非患者(iii5)进行wes,寻找纯合突变或者复合杂合突变(下图家系2)。wes结果确定了2个致病基因:myorg和shisa6.
由于myorg是唯一被确认为家系1和家系2共有的可能致病基因。研究者对剩余家系(8个隐性家系和3个遗传模式不明确的家系)的患者,进行了myorg的目的区域测序。结果在另外4个隐性家系中确定了myorg基因的纯合或者复合杂合突变(下图家系3-5)。
结果发现,myorg 基因突变与疾病共分离,lod=4.91。1000例健康对照的基因编码区测序,均没有发现这些变异。6个家系,12个患者确定的所有突变信息见下表。myorg 基因突变共解释了11.8%(6/51)的pfbc家系,46.2%(6/13)的隐性遗传pfbc家系。
在9月龄的myorg基因敲除的小鼠脑内,可观察到双侧对称性脑钙化结节的形成,且钙结节的主要成分为钙、磷等,与临床病人脑钙化的元素组分高度相似,进一步证实myorg是pfbc新的致病基因。
研究结论和意义
参考文献
1. wang c, li y, shi l,et,al. mutations in slc20a2 link familial idiopathic basal ganglia calcification with phosphate homeostasis. nat genet 2012;44(3):254-6.
2. nicolas g, pottier c, maltete d, et, al. mutation of the pdgfrb gene as a cause of idiopathic basal ganglia calcification. neurology 2013;80(2):181-7.
3. keller a, westenberger a, sobrido mj, et, al. mutations in the gene encoding pdgf-b cause brain calcifications in humans and mice. nat genet 2013;45(9):1077-82.
4. legati a, giovannini d, nicolas g, et, al. mutations in xpr1 cause primary familial brain calcification associated with altered phosphate export. nat genet 2015;47(6):579-81.
特别感谢
天昊生物特别感谢福建医科大学附属第一医院神经内科陈万金教授对天昊生物技术和服务的认可!天昊生物将长期致力于为分子生物学及医学遗传学领域的研究者提供高质量的科研策略咨询、实验技术服务和遗传数据分析,帮助广大科研人员获得更为优质的科研成果!