哮喘、花粉热(或过敏性鼻炎)和湿疹(或特异反应性皮炎)经常在个体身上同时发生,部分原因是它们具有共同的遗传来源。为了鉴定这些共同的遗传变异,研究者对具有至少一种以上上述广泛过敏性疾病表型的个体进行了全基因组关联研究(gwas;n = 360838)。最终,研究者发现136个独立的风险变异(p<3×10-8),其中的73个尚未报道过,暗示了附近的132个基因可能与过敏性疾病有关。疾病特异性作用变异位点只检测到6个,这也证实了大多数位点具有共有的风险因素。组织特异性遗传和生物过程富集分析表明共有的风险变异影响了淋巴细胞介导的免疫。6个目标基因为药物重新定位提供了机会,36个基因cpg甲基化可以作为独立遗传效应影响转录。哮喘、花粉热和湿疹因为共享大量遗传风险变异,造成免疫相关基因表达失调,最终产生了疾病的部分共存现象。
研究背景:
哮喘、花粉热和湿疹三种过敏性疾病往往相伴而生,但是其致病的遗传原因仍然不十分清楚。
研究对象:
从uk biobank、1000g数据库以及23andme公司获得的表型和基因型数据。
研究方法:
全基因组关联分析
研究流程:
研究结果:
图1、与过敏性疾病风险关联的136个遗传风险变异位点(p<3×10-8)
表1、新发现的相关位点举例列表
图2、6个疾病特异性作用变异位点(黄色三角)。例如,rs61816761[a] 等位基因变异在湿疹中是在花粉热中的1.32倍。rs2228145(黑色三角)表明在三种疾病中等位基因频率没有变化。
图3、过敏性风险变异影响的组织及生物过程
根据图3可见,这些变异主要影响血液和肺中的基因表达,并且在胞外信号诱导自噬的生物过程得到富集。
表2、潜在可行的过敏性疾病药物及目标基因列表
根据本研究结果,研究者发现了29个基因可能用于后续靶向药物开发,这些可能用于过敏性疾病治疗(表2),为药物重新定位提供理论支持。
结论: