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发稿时间：2016-09-26来源：天昊生物

如今微生物多样性研究热度持续高涨，而从大型微生物组的研究分析来看，人类微生物组所占的百分比最大，人类以及为人类服务的实验动物的微生物相关研究共占据了全部研究的66%。

目前扩增子测序在人类健康相关疾病微生物研究中使用越来越广泛，但是大家苦于找寻自己所研究疾病的相关扩增子测序文章，下面我们就盘点一下使用扩增子测序技术对各种疾病进行微生物研究的典型案例！

消化道疾病

英文题目	期刊名称	影响因子	发表时间	实验样品	测序策略
the pervasive effects of an antibiotic on the human gut microbiota, as revealed by deep 16s rrna sequencing	plos biology	4.587	2008	个人在服用环丙沙星前后粪便样本	细菌16s rdna v3，v6区测序
towards the human colorectal cancer microbiome	plos one	3.057	2011	来自6个接受了切除手术的原发性结肠腺癌患者癌组织和和癌旁粘膜样品	细菌16s rdna v1-v3区测序
structural segregation of gut microbiota between colorectal cancer patients and healthy volunteers	the isme journa	9.328	2012	46例结直肠癌患者和56例健康对照志愿者的粪便样品	细菌16s rdna v3区测序
co-occurrence of driver and passenger bacteria in human colorectal cancer	gut pathogens	2.816	2014	正常肠道组织样本（ｎ＝10），腺瘤性息肉组织样本（ｎ＝10），肿瘤组织样本（ｎ＝8）	细菌16s rdna v1-v2区测序
impacts of infection with different toxigenic clostridium difficile strains on faecal microbiota in children	scientific reports	5.228	2014	28-48月大的14个 (cdad a b )感染儿童，23个 (cdad a–b )感染儿童，43个健康儿童粪便	细菌16s rdna v1-v3区测序

呼吸道疾病

英文题目	期刊名称	影响因子	发表时间	实验样品	测序策略
insights into the respiratory tract microbiota of patients with cystic fibrosis during early pseudomonas aeruginosa colonization	springer plus	0.982	2015	5个囊性纤维化患者16–39 个月的20个痰样本	细菌16s rdna v3-v4区测序
composition and dynamics of the respiratory tract microbiome in intubated patients	microbiome	9.0	2016	15个呼吸衰竭受试者的上呼吸道口咽和深部气管分泌物样本	细菌16s rdna v6区测序
dysbiosis of upper respiratory tract microbiota in elderly pneumonia patients	the isme journa	9.328	2016	100位年龄》60岁的老年肺炎患者，27位年龄18岁-60岁的青年肺炎患者；91位健康的老年人和187位健康的青年人的口咽样本	细菌16s rdna v5-v7区测序

生殖道疾病

英文题目	期刊名称	影响因子	发表时间	实验样品	测序策略
temporal and spatial variation of the human microbiota during pregnancy	pnas	9.423	2015	49名18岁及以上的孕妇每一周以及产后的阴道、大便、唾液和牙齿/牙龈样本	细菌16s rdna扩增子测序
cervicovaginal bacteria are a major modulator of host inflammatory responses in the female genital tract	immunity	24.082	2015	94个无症状妇女阴道阴道棉签擦拭样品	细菌16s rdna v4区扩增子测序
metabolicsignatures of bacterial vaginosis	mbio	6.786	2015	40个健康女性和20个细菌性阴道炎患者的聚氨酯泡沫拭子、阴道灌洗液、子宫颈灌洗液	细菌16s rdna v3-v4区测序

口腔疾病

英文题目	期刊名称	影响因子	发表时间	实验样品	测序策略
a filifactor alocis-centered co-occurrence group associates with periodontitis across different oral habitats	scientific reports	5.228	2015	牙周炎患者和健康志愿者的唾液，牙龈上菌斑，牙龈下菌斑样品	细菌16s rdna v3-v4区测序
prediction of early childhood caries via spatial-temporal variations of oral microbiota	cell host & microbe	12.552	2015	未患龋齿儿童；患有轻微龋齿儿童；患有严重龋齿儿童的唾液和牙菌斑样品	细菌16s rdna v1-v3区测序
cigarette smoking and the oral microbiome in a large study of american adults	the isme journal	9.328	2016	从未吸过烟的志愿者；有过吸烟史但已戒烟的志愿者；一直吸烟志愿者的口腔样本	细菌16s rdna v3-v4区测序

皮肤疾病

英文题目	期刊名称	影响因子	发表时间	实验样品	测序策略
topographic persity of fungal and bacterial communities in human skin	nature	38.138	2013	十位健康成年人身上收集的易发生真菌性皮肤病的十四个皮肤部位拭子样本	细菌16s rdna v3-v4区测序；真菌18srdna v1-v6区扩增子测序，；真菌its1扩增子测序
intestinal microbiome analyses identify melanoma patients at risk for checkpoint-blockade-induced colitis	nature communications	11.329	2016	34名患黑色素瘤并且接受依普利姆玛治疗的病人粪便样本（24名没有患肠炎；10名患肠炎组）	细菌16s rdna v4-v5区测序

免疫性疾病

英文题目	期刊名称	影响因子	发表时间	实验样品	测序策略
decreased bacterial diversity characterizes the altered gut microbiota in patients with psoriatic arthritis, resembling dysbiosis in inflammatory bowel disease	arthritis rheumatol	6.009	2015	17个银屑病关节炎患者，15个牛皮癣患者，17个健康志愿者粪便样品	细菌16s rdna v1-v2区测序；
intestinal dysbiosis in ankylosing spondylitis	arthritis rheumatol	6.009	2015	9个强直性脊柱炎患者，9个健康对照的粪便样品	细菌16s rdna v4区测序

心脑血管疾病

英文题目	期刊名称	影响因子	发表时间	实验样品	测序策略
human oral, gut, and plaque microbiota in patients with atherosclerosis	pnas	9.423	2015	15个正常人和15个动脉粥样硬化患者的动脉粥样硬化斑块，肠道，口腔样本	细菌16s rdna v1-v2区测序
microbiota dysbiosis controls the neuroinflammatory response after stroke	the journal of neuroscience	5.924	2016	诱导中风小鼠和正常小鼠的粪便样本	细菌16s rdna v1-v3区测序
commensal microbiota affects ischemic stroke outcome by regulating intestinal γδ t cells	nature medicine	30.357	2015	利用抗生素清除肠道微生物后的小鼠和一组对照小鼠的粪便样本，然后中风诱导	细菌16s rdna v4-v5区测序

神经性疾病

英文题目	期刊名称	影响因子	发表时间	实验样品	测序策略
reduced diversity and altered composition of the gut microbiome in individuals with myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome	microbiome	9.0	2016	48例肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征患者和39例对照受试者的粪便样品	细菌16s rdna v4区测序
reduced incidence of prevotella and other fermenters in intestinal microflora of autistic children	plos one	3.057	2013	20名正常人和20个自闭症儿童的粪便样品	细菌16s rdna v2-v3区测序
fecal microbiota and metabolome of children with autism and pervasive developmental disorder not otherwise specified	plos one	3.057	2013	10名广泛性发展障碍儿童，10名自闭症儿童和10名正常儿童粪便样本	细菌16s rdna v1-v3区测序

乳腺癌

英文题目

期刊名称

影响因子

发表时间

实验样品

测序策略

the microbiome of aseptically collected human breast tissue in benign and malignant disease

scientific reports

5.228

2016

乳腺癌患者和良性肿瘤的乳腺组织，乳房皮肤组织，乳房皮肤和口腔黏膜样品

细菌16s rdna v3-v5区测序

the microbiota of breast tissue and its association with tumours

appl.environ. microbiol.

3.823

2016

乳腺癌患者癌旁正常组织和健康对照组的组织

细菌16s rdna v6区测序

代谢类疾病

英文题目	期刊名称	影响因子	发表时间	实验样品	测序策略
a core gut microbiome in obese and lean twins	nature	38.138	2009	胖瘦不同的同卵双胞胎（31对）、异卵双胞胎（23对）及其母亲（46个）的粪便样本	细菌16s rdna v2,v6区测序
gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults	plos one	3.057	2010	ⅱ型糖尿病男性患者18人，正常男性18人的粪便样本	细菌16s rdna v4-v6区测序
fecal microbiota imbalance in mexican children with type 1 diabetes	scientific reports	5.228	2014	8 例健康儿童，8 例初发 i 型糖尿病患者，以及 13 例已治疗两年的 i 型糖尿病患者的粪便样本	细菌16s rdna v4区测序
the stool microbiota of insulin resistant women with recent gestational diabetes, a high risk group for type 2 diabetes	scientific reports	5.228	2015	分娩3-16个月后的42名妊娠期糖尿病患者和35名健康者粪便样品	细菌16s rdna v4区测序

相信看完这些文章集锦给各领域的您已经带来思路上的启发，但是下一步的扩增子测序又怎么能缺少天昊生物呢，来看看我们扩增子测序绝对任性的服务吧！！！

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