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发稿时间：2016-07-28来源：天昊生物

为了表明小编不是标题党，我们先来看这篇2015年5月发表在translational stroke research上的文章所有的数据：

没错，不要怀疑你的眼睛，你没有看错！除了一张临床病人样本选取的表格以外，只有一张图！只有一张图哦！哎呦，不错呦……

不过，小编还是承认，小编是标题党……因为这篇文章只有4.503分，差一点没有到5分……

下面小编就和各位老师一起分析一下为什么如此简单的实验数据能发表还不错的文章。

 

背景：

临床上对于脑溢血（intracerebral hemorrhage，ich）和缺血性卒中（ischemic stroke，is）的病人，当病人情况比较危急无法进行影像学检查时，是很难进行区分的。因此，准确、便宜、快速的血检是对于临床检测的有效补充。

已有文章报道了卒中病人血液转录组表达量的变化可以作为临床检测的biomarker，并进一步阐述了卒中病人血液转录组调节免疫应答的机制，但不同剪切本在卒中病人中的情况并不清楚。

 

材料与方法：

材料：为了更精准的实验设计，本文只选取了白人男性。心源性脑卒中（cardioembolic is）、大血管卒中（large vessel）、腔隙性卒中（lacunar）、脑溢血（ich）病人及正常人对照组各4例，共20例。（上文结果中的table所示）

方法：转录组测序，只关注不同剪切本。

 

结果：

1、412个基因在五组病人/对照组全血样品转录组中存在不同的剪切本（differential alternative splicing，das），这些基因参与了细胞免疫、细胞因子、细胞死亡、存活等信号通路。

2、由于不同剪切本主要是在剪切过程中选择不同外显子造成的，进一步分析发现，292个基因的308个外显子在五组病人/对照组中的表达量存在差异。

3、根据不同外显子的表达情况，可将五组病人/对照组划分开：（如上文结果中图所示）

心源性脑卒中（cardioembolic is）相关剪切本集中在离子结合/转运和细胞结构通路中；

大血管卒中（large vessel）相关剪切本集中在细胞死亡、转录、核染色质重塑通路中；

腔隙性卒中（lacunar）相关剪切本集中在细胞应激、循环、死亡、生存通路中；

脑溢血（ich）病人相关剪切本集中在蛋白转运和定位通路中。

 

研究思路扩展：

1、卒中病人的三种不同亚型研究，其实可类推之其它任意疾病的不同临床表现，如同一癌种的不同亚型。

2、本文能发表高分文章的主要原因是临床意义，在急性病人无法影像学检测的情况下，可以使用血检来进行辅助诊断。也就是说无论各位老师要开展什么样的临床病人科研项目，必须是临床有表型差异的病人，做出结果后，也要回归临床，解释临床问题。

3、本文只是关注了不同剪切本的表达差异，但转录组测序在检测mrna表达量的同时，可进一步挖掘可变剪切（如新转录本的发现、低丰度转录本检测、新的剪切方式等）、融合基因、外显子区域的突变（snv）等信息，为各位老师的科研提供更多可挖掘的数据和创新点，也就是说一次转录组测序可以分开发表若干篇文章！

4、转录组测序在检测mrna表达量的同时，也检测到了发挥调节作用的cerna（lncrna、circrna），再加上mirna测序，就能进一步挖掘调控网络，通过几个简单的细胞实验，阐明mrna表达量改变的机理，那么文章的影响因子自然就会更上一层楼!

 

参考文献：

dykstra-aiello c, jickling g c, ander b p, et al. intracerebral hemorrhage and ischemic stroke of different etiologies have distinct alternatively spliced mrna profiles in the blood: a pilot rna-seq study[j]. translational stroke research, 2015, 6(4): 284-289.